据报道，这一水源地位于日本航空自卫队岐阜基地以西。
日本媒体报道，2020年11月，位于各务原市三井东町的三井水源地的水中就被检测出有机氟化合物含量超标，但市政府一直没有对外公布，且部分超标水至今仍在向市民供应。2021年5月，当局检查三井水源地全部13口井，其中7口井有机氟化合物含量超标，最高超标11倍。2022年11月，一口井中有机氟化合物含量被检出超标15.8倍。
4口超标严重的水井已经停用，但其余9口水井去年4月以来有机氟化合物含量仍然超标，且继续向大约半数市民、超过7万人供水。
市政府表示，目前没有收到有机氟化合物超标水损害人体健康的报告，已经开始推进水质净化设施设计，目前考虑使用活性炭作为应急净化手段。
各务原市副市长矶谷均28日在记者会上就迟迟没有公布有机氟化合物含量超标一事道歉，称市政府“认识不足”，“虽然没有义务公布检测结果，但本应该这样做”。
有机氟化合物难以降解，会在环境和人体中累积，通常被称为“永久性化学物”。有医学专家说，如果长期大量饮用被这类物质污染的水，可能影响生殖健康和儿童生长发育，引发乳腺癌、前列腺癌等疾病。
各务原市政府表示，不清楚三井水源地有机氟化合物超标原因。这一水源地位于日本航空自卫队岐阜基地以西，而驻日美军基地有机氟化合物泄漏污染水源事件正在日本发酵。
东京都政府本月5日公布，位于东京多摩地区的美军横田基地2010年至2012年间共发生3起含有机氟化合物的泡沫灭火剂泄漏事件。东京都和基地周边地方政府要求日本中央政府提供更多详细情况。14日，内阁官房长官松野博一在记者会上承认存在上述事件。美军则不承认灭火剂泄漏至基地外。
28日，防卫大臣浜田靖一在记者会上承认，防卫省2019年就获知美军灭火剂泄漏，但过了4年才告知东京都等地方政府。按日本防卫省的说法，迟迟未公布的主要原因包括与美军协调需要时间、防卫省相关人事出现变动、负责人之间交接工作不到位等。
东京都已有17个地区的地下水检测出有机氟化合物超标，多摩地区超过半数居民血检结果异常。
除东京都，日本十多个都道府也检测出有机氟化合物浓度超标，包括驻日美军最多的冲绳县。冲绳县政府最新调查显示，美军冲绳基地周边30个地点的水体被检测出有机氟化合物超标。该县一个市民团体今年2月发布的调查结果显示，美军冲绳基地周边居民中，大约40%血检结果异常。